鸚哥魚亞歷克斯原本只是個平凡的珊瑚礁清潔工。但在某天，從天而降的幾滴黑色石油打破了珊瑚礁的寧靜。一心想要保護珊瑚礁的亞歷克斯想要找出問題，請求國王允許他前往調查。然而沒想到的是，他卻因為清潔工的身分反遭國王羞辱。亞歷克斯決定離開珊瑚礁，游向幽深的大海獨力進行調查。亞歷克斯的夥伴也陪著他踏上旅程。經驗豐富的河豚艾德、一心想要證明自己已經長大的小海馬克麗絲汀，以及孤單的鰻魚艾拉諾決定一起冒險。面對海洋污染的考驗以及海中惡霸的威脅，四個小夥伴不懼危險，靠著堅強的意志力與友情，努力拯救珊瑚礁。